Сохраняется ли отсрочка от армии при переводе в другой вуз после академического отпуска?

Здравствуйте! 
Право на отсрочку от призыва на военную службу за вами сохранится, поскольку процедура перевода после академического отпуска полностью соответствует требованиям абзаца 15 подпункта «а» пункта 2 статьи 24 Федерального закона № 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе». Для сохранения отсрочки закон устанавливает три обязательных условия: перевод должен осуществляться на программу того же уровня образования (в вашем случае — бакалавриат или специалитет), принимающий факультет должен иметь государственную аккредитацию, а общий срок обучения не должен увеличиться более чем на один год. Так как вы переводитесь с начала 2-го курса на начало 2-го курса, нормативный срок вашего обучения сдвигается ровно на 1 год (за счет времени, проведенного в академическом отпуске), что укладывается в рамки закона. При этом досдача разницы в учебных программах (академической задолженности) на законность отсрочки никак не влияет.
Что касается порядка действий, вам не нужно предварительно выходить из академического отпуска в старом вузе, чтобы продолжить учебу в новом. Перевод обучающихся регулируется Приказом Минобрнауки России, согласно которому процедура оформляется напрямую: новый университет выдает вам справку о переводе, на основании которой прежний вуз издает приказ об отчислении в связи с переводом (а не по собственному желанию, что критически важно для военкомата!). Автоматически ваш академический отпуск в первом вузе прекратится в момент отчисления. Сразу после издания приказа о зачислении в новом университете вам необходимо взять в его военно-учетном столе справку (ранее — Приложение № 2 к Перечню, сейчас данные также передаются в Реестр воинского учета) и предоставить ее в военный комиссариат для подтверждения непрерывности вашей отсрочки.