Исходя из ст. 239 Трудового кодекса РФ,
Материальная ответственность работника исключается в случаях возникновения ущерба вследствие непреодолимой силы, нормального хозяйственного риска, крайней необходимости или необходимой обороны либо неисполнения работодателем обязанности по обеспечению надлежащих условий для хранения имущества, вверенного работнику.
Т.е., в Вашем случае, в связи с текучкой кадров и низкой организацией учета, вообще проблемно возложить на Вас материальную ответственность.
Согласно ч. 2 ст. 242 Трудового кодекса РФ,
Материальная ответственность в полном размере причиненного ущерба может возлагаться на работника лишь в случаях, предусмотренных настоящим Кодексом или иными федеральными законами.
А именно, договор о полной материальной ответственности с Вами заключали?
Если нет, то тогда ст. 241 Трудового кодекса РФ,
За причиненный ущерб работник несет материальную ответственность в пределах своего среднего месячного заработка, если иное не предусмотрено настоящим Кодексом или иными федеральными законами.
Обращаю Ваше внимание на ст. 247 Трудового кодекса РФ,
До принятия решения о возмещении ущерба конкретными работниками работодатель обязан провести проверку для установления размера причиненного ущерба и причин его возникновения. Для проведения такой проверки работодатель имеет право создать комиссию с участием соответствующих специалистов.
Истребование от работника письменного объяснения для установления причины возникновения ущерба является обязательным. В случае отказа или уклонения работника от предоставления указанного объяснения составляется соответствующий акт.
Работник и (или) его представитель имеют право знакомиться со всеми материалами проверки и обжаловать их в порядке, установленном настоящим Кодексом.
Следовательно, работодатель обязан установит механизм образования ущерба, и имя виновника ущерба выявляется вследствии выявления этого механизма. И после виновное лицо обязательно опрашивают.
В Вашем случае ничего этого сделано не было и право на обращение в суд у работодателя не возникло.