Мария, здравствуйте!
Договор считается заключенным в силу следующего:
Статья 434 ГК РФ. Форма договора
2.Договор в письменной форме может быть заключен путем составления одного документа,подписанного сторонами, а также путем обмена письмами, телеграммами, телексами, телефаксами и иными документами, в том числе электронными документами, передаваемыми по каналам связи, позволяющими достоверно установить, что документ исходит от стороны по договору.
Т.е. он подписан и оттиск печати не является обязательным реквизитом, если этого нет в договоре.
Вам нужно собрать доказательства исполнения договора и предоставить в суд, если он будет. В данном случае сделайте фотографирование сайта. Кроме того, нужно соотнести результат с техническим заданием, чтобы у суда не возникло вопросов.
Относительно прокуратуры, то она направит заявление в полицию для проведения проверки в порядке ст. 144 УПК РФ. Так как у Вас работы/услуги выполнены, то достаточно предоставить сотруднику полиции результат, договор и пояснения.
Конечно для полной оценки лучше обратиться к юристу за личной платной консультации, чтобы выработать сразу линию защиты.