ФАС подают вообще жалобу, а договор признают недействительным в Арбитражном суде
Согласно ст. 431.1. ГК РФ
Сторона, которая приняла от контрагента исполнение по договору, связанному с осуществлением его сторонами предпринимательской деятельности, и при этом полностью или частично не исполнила свое обязательство, не вправе требовать признания договора недействительным, за исключением случаев признания договора недействительным по основаниям, предусмотренным статьями 173, 178 и 179 настоящего Кодекса, а также если предоставленное другой стороной исполнение связано с заведомо недобросовестными действиями этой стороны.
ГК РФ Статья 173. Недействительность сделки юридического лица, совершенной в противоречии с целями его деятельности
ГК РФ Статья 178. Недействительность сделки, совершенной под влиянием существенного заблуждения
ГК РФ Статья 179. Недействительность сделки, совершенной под влиянием обмана, насилия, угрозы или неблагоприятных обстоятельств
Какое основание для искового заявления будет у Вас.
Если Вам помог мой ответ оцените его пожалуйста.
У ФАС тоже есть полномочия давать предписания по изменению условий договора
Но не признавать его Недействительность.