Нужно ли в данном случае подписать доп соглашение?

Здравствуйте Олеся!

Вы пишите:  

Подскажите, пожалуйста, нам прислали доп.соглашение, мы не согласны м пунктами и написали протокол разногласий. Необходимо ли подписывать допник?

Вы вправе как согласовать протокол разногласий, так и отклонить его. Если соответствует нормам законодательства и устраивает стороны, то соответственно стоит подписывать, так как это часть договора, причем неотъемлемая, это должно быть указано в протоколе.

Олеся, здравствуйте! 

Если Вы составили протокол разногласий, то в доп. соглашении нужно указать «с протоколом разногласий» и приложить этот протокол. При этом доп. соглашение подписывается.