Заказчик обязан в течение 2 (двух) рабочих дней со дня получения Акта оказанных услуг подписать его и отправить Исполнителю 1 (один) экземпляр или направить мотивированный отказ

Тут нужно исходить из следующего

Согласно ст. 779 ГК РФ

по договору возмездного оказания услуг исполнитель обязуется по заданию заказчика оказать услуги (совершить определенные действия или осуществить определенную деятельность), а заказчик обязуется оплатить эти услуги.

Целью подтверждения исполнения обязательства в полном объеме служит составленный и подписанный сторонами акт приема-передачи, который является доказательством, подтверждающим факт оказания услуг, и основанием для их оплаты.

Необходимость документального оформления результатов оказанной услуги и передача их заказчику предопределенаи в силу прямого указания ст. 720 ГК РФ, обозначавшей, что

заказчик обязан в сроки и в порядке, которые предусмотрены договором подряда, с участием подрядчика осмотреть и принять выполненную работу (ее результат), а при обнаружении отступлений от договора, ухудшающих результат работы, или иных недостатков в работе немедленно заявить об этом подрядчику.

Применение нормы ст. 720 ГК РФ предопределено в силу прямой оговорки ст. 783 ГК РФ — общие положения о подряде (статьи 702 — 729) и положения о бытовом подряде (статьи 730 — 739) применяются к договору возмездного оказания услуг, если это не противоречит статьям 779 — 782 настоящего Кодекса, а также особенностям предмета договора возмездного оказания услуг.

В Вашем случае порядок и условия принятия результатов оказанной услуги определены п.  4.3 — 4.5 договора, 

4.3.  Прием оказанных Услуг в соответствии с Календарным планом (Приложение № 2 к Договору), подтверждается подписанием Сторонами Акта оказанных услуг.

4.4.  Исполнитель передает Заказчику соответствующий Акт оказанных услуг почтовым или электронным отправлением либо нарочно.

4.5.  Заказчик обязан в течение 2 (двух) рабочих дней со дня получения Акта оказанных услуг подписать его и отправить Исполнителю 1 (один) экземпляр или направить мотивированный отказ. В случае отсутствия мотивированного отказа от подписания Акта оказанных услуг, Акт считается подписанным, а результаты оказанных услуг — надлежащими.

Таким образом, поскольку Вы акт направили и не получили обратной связи результат услуг считается принятым на условиях, определенных договором.

Отправлять таким образом акт по электронной почте и всё?

Отправлять акт необходимо тем способом, который предусмотрен в Договоре.

В Вашем случае согласно пункту 4.4 Договора:

4.4. Исполнитель передает Заказчику соответствующий Акт оказанных услуг почтовым или электронным отправлением либо нарочно.

Т.е. акт может быть направлен тремя способами:

— по эл. почте;

— почтовым отправлением;

— передан наручно.

Если вы отправляете по эл. почте важно, отправлять его на эл. почту Заказчику, указанную в договоре во избежание возможных споров.

Кроме того, я бы также рекомендовал дублировать отправку актов Почтой России по почтовому адресу, указанному Заказчику, в Договоре. Отправлять ценным письмом с описью вложения, в описи указывать, что отправляются акты по Договору.

Прикрепил пример договора, который заключаем с клиентами. Пункт 4 — про сдачу проекта.Мне важно понимать, когда считать проект сданным, если клиент не отвечат (телефон, чат, электронная почта).Отправлять таким образом акт по электронной почте и всё? Ждать 3 дня ответа и считать проект сданным, если ответа не было?

В силу п. 4.4. вы направляете подписанный акт указанным способом. Договором предусмотрено электронное отправление.

После получения акта у Заказчика 2 рабочих дня на его подписание, в случае, если акт, подписанный со стороны Заказчика не направлен обратно и при отсутствии мотивированного отказа услуги считаются принятыми.

Срок 2 рабочих дня следует отсчитывать с дня следующего за днем вручения/получения отправления Заказчиком. 

Рекомендую внести правки:

в пункт 4.4. Договора, а именно определить способ электронного отправления.

Да, отравляете договор по электронной почте и если в течении трёх дней ответа не последовало, то проект считается сданным.

То, что Вы записываете видео, очень правильно. Я всем клиентам даю советую любой юридически значимый факт фиксировать посредством аудио- или видеозаписи. Эти доказательства можно заверять у нотариуса, либо проводить по ним экспертизу и они сейчас очень активно принимаются судами. Более того, для суда такие доказательства приоритетны, поскольку максимально наглядны.

Александр, еще раз повторюсь, я, грубо говоря, говорю о необходимости подстраховаться. Переживать Вам особо не о чем, вероятность обращения в суд есть всегда, даже когда услуги полностью приняты и подтверждены другой стороной. Но в обороте обычно вырабатывается правило, когда воля стороны уточняется на всякий случай. 

А в остальном, конечно, если Вы все фиксируете и там видна «комплектность» услуги и ее качество (это может явствовать и из других доказательств), проблем не возникнет.