Правомерно ли обращаться в суд или есть иные способы списания?

Камилла, добрый вечер!

Трудовое законодательство предусматривает право работодателя на привлечение работника к материальной ответственности. Данные вопросы регламентированы в главе 39 Трудового кодекса Российской Федерации.

Полагаю, в данном случае, взыскание задолженности в судебном порядке наиболее эффективно.

Вам необходимо учесть, что существует срок исковой давности, следовательно, с учетом задолженности работника длящейся с 2016 г., чем раньше Вы обратитесь в суд, тем больше сможете взыскать.