Егор, добрый день.
Действительно, ответственность предусмотрена ст.129.13 НК РФ. По ч.1 -20% от суммы расчета, повторное в течение 6 месяцев -в сумме расчета.
При этом правонарушение считается совершенным повторно, если ранее налогоплательщик был привлечен к ответственности за аналогичное правонарушение, т.е. решение о привлечении к ответственности вступило в силу. Согласно ч.3 ст.108 НК РФ
3. Основанием для привлечения лица к ответственности за нарушение законодательства о налогах и сборах является установление факта совершения данного нарушения решением налогового органа, вступившим в силу.
ч.3 ст.112 НК РФ также установлено, что
Лицо, с которого взыскана налоговая санкция, считается подвергнутым этой санкции в течение 12 месяцев с момента вступления в законную силу решения суда или налогового органа
Следовательно, если сейчас Вы исполните в один момент свои обязанности по оформлению чеков, это не будет основанием для наложения штрафа в размере 100%. ответственность наступит п ч.1 по всем фактам расчетов без чеков.
Также стоит отметить, что у Вас есть возможность ходатайствовать о снижении суммы штрафа в связи с наличием смягчающих обстоятельств (см. ч.3 ст.114 НК РФ). Перечень смягчающих обстоятельств поименован в ст.112 НК РФ, но не является исчерпывающим.