Здравствуйте, Татьяна!
Работникам бюджетной сферы, работающим в РКС, оплата к месту использования отпуска и обратно производится один раз в два года (ст. 325 ТК РФ) и в соответствии с Постановлением Правительства РФ от 12 июня 2008 г. N 455 «О порядке компенсации расходов на оплату стоимости проезда и провоза багажа к месту использования отпуска и обратно для лиц, работающих в федеральных государственных органах, государственных внебюджетных фондах Российской Федерации, федеральных государственных учреждениях, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, и членов их семей», а также членам их семей:
3. К членам семьи работника учреждения, имеющим право на компенсацию расходов, относятся неработающие муж (жена), несовершеннолетние дети (в том числе усыновленные), фактически проживающие с работником.
Поскольку в период отпуска супруг был неработающий, Вы вполне на законном основании можете подать авансовый отчет для компенсации расходов с учетом супруга.
Вы еще в отпуске, а супруг уже устроился? Или Вы уже вернулись из отпуска, но срок его не окончился еще?