Здравствуйте. Если в отказе действительно указано, что справка должна быть выдана не позднее чем за 30 дней до подачи заявления, а вы получили её за 3 дня до подачи, то такой отказ необоснован. Наоборот, справка соответствует указанному требованию, поскольку выдана в пределах 30-дневного срока.
То, что сын в этом году заканчивает обучение, само по себе не является основанием для отказа, если на момент подачи заявления он фактически обучался по очной форме и представил действующую справку. Законность решения администрации оценивается исходя из обстоятельств, существовавших именно на дату обращения, а не на момент рассмотрения заявления.
Рекомендую запросить у администрации полный мотивированный отказ с указанием конкретных норм регионального законодательства, на основании которых вам отказали. Если иных оснований нет, решение имеет смысл обжаловать сначала в прокуратуру либо вышестоящий орган, а при необходимости — в суд в порядке главы 22 КАС РФ. В соответствии со статьями 218–219 КАС РФ вы вправе требовать признания отказа незаконным и обязания администрации повторно рассмотреть ваше заявление.
Могу изучить текст отказа и региональный закон о предоставлении земельных участков многодетным семьям, после чего подготовить мотивированную жалобу или административное исковое заявление в суд.