Обязана ли беременная сотрудница отрабатывать время отсутствия по причине плохого самочувствия?

Предупреждать о том, что Вы будете отсутствовать по уважительной причине и предоставлять справки нужно обязательно. Иначе как узнают, что у Вас уважительная причина для отсутствия на работе; Иначе- придется отрабатывать.

ст. 254 Трудового кодекса РФ, которая обязывает руководителя сохранять средний заработок беременной женщине при отсутствии на работе по уважительной причине и предусматривает следующее:
Беременным женщинам в соответствии с медицинским
заключением и по их заявлению снижаются нормы выработки, нормы обслуживания либо эти женщины переводятся на другую работу, исключающую воздействие
неблагоприятных производственных факторов, с сохранением среднего заработка по прежней работе.
До предоставления беременной женщине другой
работы, исключающей воздействие неблагоприятных производственных факторов, она подлежит освобождению от работы с сохранением среднего заработка за все
пропущенные вследствие этого рабочие дни за счет средств работодателя.
При прохождении обязательного диспансерного обследования в медицинских организациях
за беременными женщинами сохраняется средний заработок по месту работы.
Женщины, имеющие детей в возрасте до полутора лет, в случае невозможности выполнения прежней работы переводятся по их заявлению на другую работу с оплатой труда по выполняемой работе, но не ниже среднего заработка по прежней работе до достижения ребенком возраста полутора лет.