Подавать ли мне жалобу в трудовую инспекцию на работодателя, если я занижала зарплату?

Желаю дополнить коллегу. Вам не стоит волноваться за возможность предъявления претензий со стороны работодателя, так как в Вашем случае

согласно ст. 138 ТК РФ 

Общий размер всех удержаний при каждой выплате заработной платы не может превышать 20 процентов... 

Согласно ст. 247 ТК РФ

До принятия решения о возмещении ущерба конкретными работниками работодатель обязан провести проверку для установления размера причиненного ущерба и причин его возникновения. Для проведения такой проверки работодатель имеет право создать комиссию с участием соответствующих специалистов.
Истребование от работника письменного объяснения для установления причины возникновения ущерба является обязательным. В случае отказа или уклонения работника от предоставления указанного объяснения составляется соответствующий акт.
Работник и (или) его представитель имеют право знакомиться со всеми материалами проверки и обжаловать их в порядке, установленном настоящим Кодексом.

Согласно ст. 248 ТК РФ 

Взыскание с виновного работника суммы причиненного ущерба, не превышающей среднего месячного заработка, производится по распоряжению работодателя. Распоряжение может быть сделано не позднее одного месяца со дня окончательного установления работодателем размера причиненного работником ущерба.
Если месячный срок истек или работник не согласен добровольно возместить причиненный работодателю ущерб, а сумма причиненного ущерба, подлежащая взысканию с работника, превышает его средний месячный заработок, то взыскание может осуществляться только судом.
При несоблюдении работодателем установленного порядка взыскания ущерба работник имеет право обжаловать действия работодателя в суд.

Вывод. Если не проводилась проверка, то действия работодателя по невыплате Вам заработной платы являются незаконными. Но это не лишает его возможности предъявить Вам требования по возмещению ущерба в дальнейшем в судебном порядке, если конечно докажет это.