Какие документы необходимо подготовить для подачи иска?

Здравствуйте.

Отвечу по пунктам: в описанной ситуации шансы выписать бывшую супругу через суд, как правило, хорошие, если квартира действительно ваша личная, брак прекращён, совместное проживание закончено и иного жилья у неё нет только «на бумаге», а фактически она живёт в другом месте.

1. Перспективы иска
Суды обычно исходят из того, что:

регистрация сама по себе не даёт бывшему супругу пожизненного права пользования, если квартира не является совместно нажитой и семейные отношения прекращены;
если бывший супруг долгое время не проживает, не участвует в содержании жилья, сложились иные жилищные отношения – его признают утратившим право пользования и снимают с регистрационного учёта.
То есть при подтверждённых фактах непроживания около 3 лет и отсутствии договорённости о пожизненном пользовании суд, как правило, встаёт на сторону собственника.

2. Какие документы подготовить
Обычно прикладывают:

Правоустанавливающие документы: договор купли‑продажи, дарения, свидетельство / выписка ЕГРН, подтверждающая, что вы единственный собственник и квартира не нажита в браке.
Свидетельство о расторжении брака.
Справку о зарегистрированных лицах (форма № 9, выписка из домовой книги) – что бывшая супруга числится прописанной.
Доказательства её фактического непроживания:

акты управляющей компании / ТСЖ, участкового,
показания соседей,
возможные документы о её проживании по другому адресу,
отсутствие её вещей, передача ключей и т. п.
Переписку, где вы просите её добровольно сняться с учёта и получаете отказ – это подтверждает досудебные попытки урегулирования.
Иск подаётся в районный суд по месту нахождения квартиры с требованиями:

признать бывшую супругу утратившей право пользования жилым помещением;
снять её с регистрационного учёта.
3. Судебные расходы и коммунальные платежи
Судебные расходы
В рамках иска вы вправе заявить о взыскании судебных расходов: госпошлины, услуг представителя (юриста/адвоката), почтовых расходов и т. д.
Если суд удовлетворит ваши требования полностью или частично, он, как правило, возлагает разумные подтверждённые расходы на проигравшую сторону.
Важно сохранять договор с юристом и квитанции/акты об оплате его услуг.

Коммунальные платежи
Здесь нужно разделить два вопроса:

Коммуналку с вас как собственника управляющая компания берёт по закону, независимо от того, проживает ли фактически зарегистрированный человек, особенно если расчёт идёт по площади или по количеству собственников.
Взыскать с бывшей супруги в рамках этого же иска обычно проблематично, потому что она как раз НЕ проживает (вы сами на этом настаиваете).
Суды склонны взыскивать «плату за пользование жильём» и коммунальные расходы, когда человек фактически живёт без законных оснований – тогда это неосновательное обогащение (ориентир на ст. 1102 ГК РФ и практику по незаконному проживанию).
В вашей ситуации вы будете доказывать обратное – что она не живёт, а только зарегистрирована. Это не сочетается с требованием о взыскании платы «за проживание».

Лучше:

в этом деле сосредоточиться на прекращении права пользования и снятии с учёта;
вопросы перерасчёта коммунальных платежей решать с управляющей компанией отдельно (на основании факта непроживания, счётчиков и т. п.).
4. Стоимость услуг юриста
По рынку (по РФ в целом, без привязки к конкретному региону):

подготовка искового заявления с анализом документов: ориентировочно от 10–50 тыс. руб. и выше;
полное сопровождение дела (подготовка иска, участие в 1–2 заседаниях, переписка с судом): часто в диапазоне 25–150 тыс. руб., иногда выше в крупных городах.
Точные суммы сильно зависят от региона, сложности дела и статуса юриста/адвоката; но эти расходы при выигрыше можно просить взыскать с ответчицы.

 Перспективы у вас выглядят неплохо, при условии что детей, зарегистрированных вместе с бывшей супругой в вашей квартире, нет (для несовершеннолетних совсем другие подходы).